Закінчила середню школу №19 р. Кемерово із золотою медаллю і вступила до Кемеровського медичного інституту на лікувальний факультет. Закінчила інститут із червоним дипломом у 1983 році. Наступного року вступила до аспірантури Академії медичних наук у Москві.
Її чоловіком став молекулярний біолог Ігор, від якого телеведуча народила двох синів. Любов до медицини та бажання стати лікарем Олена успадкувала від своїх батьків. Мати Галина та батько Василь були лікарями. за національності Малишева – російська, хоча багато хто приписує їй єврейських предків.
Ціни у медичному центрі Олени Малишової, Москва: медичні послуги від 160 до 153000 руб., У тому числі первинний прийом лікарів від 1200 до 21000 руб., Лікування від 160 до 153000 руб.
рублів) Малишева 2018-го заробила 65 млн чистого прибутку (виручка від продажів — 460 млн). Наступним за прибутковістю підприємством зірки екрану виявився рекламний бізнес, який приніс 38 млн. рублів, потім медичний центр – 1,8 млн. рублів.