Зараз може бути два основні варіанти бойового оснащення крилатими ракетами: перший – 12 крилатих ракет великої дальності типу Х-101, другий – 12 крилатих ракет великої дальності типу Х-55СМ.
Він призначений для ураження ядерною та звичайною зброєю найважливіших об'єктів у глибокому тилу противника. Здатний нести на борту 12 крилатих ракет, все озброєння розміщено усередині фюзеляжу. В Росії Ту–160 за його грацію називають "Білим лебедем", за кодифікацією НАТО – Blackjack ("Блекджек").
У разі поразки цілей на меншій дальності на озброєння беруть аеробалістичні ракети Х-15 С: 24 ракети, по 12 на кожній МКУ.
Ту–95 має безліч модифікацій, проте зараз російська армія має на своєму озброєнні Ту-95МС та Ту-95МСМ. Які ракети несе Ту–95: Ту-95МСМ можуть нести більш сучасну крилату ракету Х-101. Всі інші моделі здатні нести лише радянські ракети Х-55 чи Х-555.