Основна частина коріння яблуні розташовується в найбільш родючому і пухкому ґрунтовому шарі на глибині 20-80 см. Окремі коріння спрямовані вертикально вниз і можуть йти у пошуках води на глибину до 5 м, а посушливих місцях – до 10 м.
Дерева з розлогою кулястою або яйцеподібною кроною заввишки 2-10 м і вище. Коренева система стрижнева, з бічними відгалуженнями.
Коренева система плодових дерев має свої особливості. У яблуні (Malus) глибша коренева система – основна маса її коріння залягає на глибині 50-60 див. Коріння груші (Pyrus) розповсюджуються на глибині від 20 до 150 см, але часто йдуть на значну глибину.